PCR总是有杂带怎么消除
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解决时间 2021-02-06 08:19
- 提问者网友:寂寞梧桐
- 2021-02-05 19:47
PCR总是有杂带怎么消除
最佳答案
- 五星知识达人网友:由着我着迷
- 2021-02-05 20:03
可以小幅提高退火温度,大概1-2度,这样可以增加引物结合的准确性。如果没有用,建议用BLAST检查一下引物的序列是否在基因组内其他位置有相似序列。
如果杂带无论如何也无法消除建议重新设计引物,或者使用切胶的方法提纯追问提高退火温度,条带出的少了,但是仍有杂带。肯定是引物不特异吗?我直接用的外文文献里的引物。追答你所扩增的基因以及采用的物种都和外文文献里的一模一样吗?如果不是,建议重新检查一下你所要扩增的 locus 以及你所采用的物种的基因组。
其实有时候杂带的出现真的很难解释,我以前那个project就出现过用尽方法也除不掉的神秘杂带。这种情况下切胶纯化是一种比较有效的方法~~~。如果纯化后产物浓度过低可以稀释一下后用纯化过的产物作为模板,再来一轮PCR, 有时可以有效去杂带追问是的,根据本实验室除了时间稍稍不同及酶的用量不同,其他都一样。追答那就切胶纯化吧~,如果杂带亮度明显低于主带亮度,那纯化再稀释一下,用产物作模板再来一轮PCR是比较有可能成功的。
或者重新设计下引物。追问非常感谢!!!追答嗯,据说Hot-start PCR 对消杂带也有效果,可以一试
如果杂带无论如何也无法消除建议重新设计引物,或者使用切胶的方法提纯追问提高退火温度,条带出的少了,但是仍有杂带。肯定是引物不特异吗?我直接用的外文文献里的引物。追答你所扩增的基因以及采用的物种都和外文文献里的一模一样吗?如果不是,建议重新检查一下你所要扩增的 locus 以及你所采用的物种的基因组。
其实有时候杂带的出现真的很难解释,我以前那个project就出现过用尽方法也除不掉的神秘杂带。这种情况下切胶纯化是一种比较有效的方法~~~。如果纯化后产物浓度过低可以稀释一下后用纯化过的产物作为模板,再来一轮PCR, 有时可以有效去杂带追问是的,根据本实验室除了时间稍稍不同及酶的用量不同,其他都一样。追答那就切胶纯化吧~,如果杂带亮度明显低于主带亮度,那纯化再稀释一下,用产物作模板再来一轮PCR是比较有可能成功的。
或者重新设计下引物。追问非常感谢!!!追答嗯,据说Hot-start PCR 对消杂带也有效果,可以一试
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