“有些物质直接由原子构成”（铁咯）和“原子不能直接构成物质”有区别吗？

原话是“分子直接构成物质，原子不能”，不会错的啦！书上的

1.原子晶体是由原子直接构成的.
----如金刚石、晶体硅、二氧化硅、碳化硅、氮化硅等。
----相互作用为共价键，非常强烈，故原子晶体熔沸点高，硬度大。

2.稀有气体是由原子构成的,更确切的说是由单原子分子构成的.
----稀有气体原子的性质更像分子,其相互作用是分子间作用力,很弱.

3.金属晶体并非由金属原子构成.
----金属晶体是由金属离子和自由电子构成.其相互作用是金属键.
----一般写方程式时用原子表示.

结论:由原子构成的物质只能是原子晶体

化学里，“分子”指的是“保持物质化学性质的最小微粒”，如果该物质是由原子、离子、分子构成的，那么“分子”指的是构成该物质的原子、离子、分子。
当然还有物质的概念，物质存在的形式也不同，因此，构成的物质可能是不同的表现形式，关键是它是存在的。

原子也能够直接构成物质。

构成物质的粒子有三种：分子、原子、离子

首先物质可以由原子（Fe），分子（CO2），离子（NaCl)构成。

其次你的第二句话是不对的。