我为甲方，与乙方签了一份建筑合同，在我不知情的情况下乙方吧活转给了丙方，活以完工我很满意，

但是乙方法人失踪，我想把款付给丙方如何走手续，我和丙方都和失踪的有合同

同意楼上说法。合同为大，到时候乙方真的找你麻烦，你是很难解释的。最好是找相关建设部门协商，以民工要工资解决这个问题（当前民工工资在建设行业是比较大的事情可以以这个为借口），共同制定协议，有相关部门参与协议签字盖章就稳妥多了。
建设行业很多不规范的事情不出事没关系，一旦出了事情牵涉到法院，结果就和通常的做法完全不同了，通常现实中也存在甲方直接给第3方付款的情况，但是三方都比较熟信得过一般不出事，但是你这个情况乙方失踪了就很特殊了，建议稳妥处理

你好！ 呃，这个乙方做的真舒服。。。 这种情况下你最好别自作主张，毕竟你和丙方没有合同关系，虽然他干了活但合同不是跟你签的，你如果付了他款，将来乙方拿着合同找你要钱，你就傻眼了。 可以让丙方起诉乙方，让法院来判断该怎么做才合乎法律。 仅代表个人观点，不喜勿喷，谢谢。