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同样的样本用QPCR能扩增,但是巢氏PCR却扩增不出来,为什么?

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解决时间 2021-03-25 14:51
同样的样本用QPCR能扩增,但是巢氏PCR却扩增不出来,为什么?
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巢氏PCR是先扩增大片段,再扩增小片段,通常只有在防止非特异扩增的时候会采用这种办法。而qPCR一般只扩增小片段。
你说的巢氏PCR没有做出来,是指大片段就没做出来,还是大片段做出来,小片段没结果呢?
如果大片段就没做出来,可能要考虑引物特异性,或者反应条件和扩增效率的问题。
如果只是小片段没扩出来,可能就需要看看大片段扩增出来的是不是目标片段,如果扩增出来的大片段本身就不含有小片段,就没办法扩增出来。
所以如果片段不相关,光是样本相同是无法找到原因的。追问我前几个月用同样样本抽提得到的DNA,却可以用巢氏p出来,现在却整不出来了,觉得不应该是样本的问题。追答问题就在于是几个月前的样本,因为在保存过程中可能会出现降解或者其他问题。如果目标基因那段刚好降解完了,或者量变少了,都会影响结果的。所以如果确保其他东西都没问题,就换下模板试试。
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