公司如果要扣百分之五的工资是从基本工资扣还是应发工资扣

公司如果要扣百分之五的工资是从基本工资扣还是应发工资扣

是基础工资的百分之五，基础工资 = 基本工资+岗位工资+各种津贴+加班工资。
　　加班工资是基础工资的组成部分，基础工资里面包含加班工资，但是加班工资不等于基础工资。
　　《工资支付暂行规定》第十五条 用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人 单位可以代扣劳动者工资：
(l)用人单位代扣代缴的个人所得税；
(2)用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
(3)法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
(4)法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
　　第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照 劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但 每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

按照规章制度扣，且你可以问公司是按照哪条规定扣的工资，否则就是公司克扣工资行为。公司不得克扣工资，否则劳动者可以投诉到劳动局监察大队。公司扣工资最多扣月工资的20%。
《劳动合同法》第八十五条：用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：
　　（一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；
　　（二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；
　　（三）安排加班不支付加班费的；
　　（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。