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如何分析real time PCR的数据结果

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解决时间 2021-04-04 04:18
如何分析real time PCR的数据结果
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学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔
融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁.不同的处理方法得到不
同的结果.
做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法
内参基因:对照组1、对照组2、对照组3
实验组1、实验组2、实验组3
目的基因:对照组1、对照组2、对照组3
实验组1、实验组2、实验组3
数据处理的时候,是先分别取内参、目的基因的三次平行实验的均值再拿相应均值相减得到
还有对于内参基因的数据,如果所得Ct 值差值在1 以内,是否可以将所有的内参取平均,
另外对于这个REAL-TIME PCR 的结果除了用EXCEL 处理之外有没有其他比较可信方便的
内参基因: 18s for control, 18s for treatment sample
目的基因: control sample, treatment sample
复孔取平均值
△ Ct for control sample = Ct of comtrol sample - Ct 18s for control
△ Ct for treatment sample = Ct of treatment sample - Ct 18s for treatment sample
△ △ Ct = △ Ct for treatment sample - △ Ct for control sample
2^(-△ △ Ct)
2^(-△ △ Ct) =1 means miRNA expression no change
2^(-△ △ Ct) 1 means expression increase after treatment
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学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔
融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁。。。不同的处理方法得到不
同的结果。。。
做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法
内参基因:对照组1、对照组2、对照组3
实验组1、实验组2、实验组3
目的基因:对照组1、对照组2、对照组3
实验组1、实验组2、实验组3
数据处理的时候,是先分别取内参、目的基因的三次平行实验的均值再拿相应均值相减得到
还有对于内参基因的数据,如果所得Ct 值差值在1 以内,是否可以将所有的内参取平均,
另外对于这个REAL-TIME PCR 的结果除了用EXCEL 处理之外有没有其他比较可信方便的
内参基因: 18s for control, 18s for treatment sample
目的基因: control sample, treatment sample
复孔取平均值
△ Ct for control sample = Ct of comtrol sample - Ct 18s for control
△ Ct for treatment sample = Ct of treatment sample - Ct 18s for treatment sample
△ △ Ct = △ Ct for treatment sample - △ Ct for control sample
2^(-△ △ Ct)
2^(-△ △ Ct) =1 means miRNA expression no change
2^(-△ △ Ct) <1 means expression decrease after treatment
2^(-△ △ Ct) >1 means expression increase after treatment
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