用Perl语言以及blast编程来完成下面三个问题比对序列,不知道怎么做,大神能提供一下思路吗?
答案:1 悬赏:50 手机版
解决时间 2021-04-07 02:03
- 提问者网友:雪舞兮
- 2021-04-06 13:55
用Perl语言以及blast编程来完成下面三个问题比对序列,不知道怎么做,大神能提供一下思路吗?
最佳答案
- 五星知识达人网友:舊物识亽
- 2021-04-06 14:54
这个和perl没有太大关系,难道要用bioperl?
如果不用bioperl,可以手动从数据库中下载AT1G17600.1蛋白质序列,然后一步一步的做下面的命令追问这是上课的时候出的题目,老师已经提供了protein数据库和cDNA数据库了,请问具体怎么写命令和程序,老师出的题目超出我的能力范围了,请多多指教追答你先从数据库找到那个序列啊,不用写程序的啊
跑blast,上面命令都写清楚了
你已经把命令都写了啊:blastdbcmd -query_bacth idlist -out final
如果不用bioperl,可以手动从数据库中下载AT1G17600.1蛋白质序列,然后一步一步的做下面的命令追问这是上课的时候出的题目,老师已经提供了protein数据库和cDNA数据库了,请问具体怎么写命令和程序,老师出的题目超出我的能力范围了,请多多指教追答你先从数据库找到那个序列啊,不用写程序的啊
跑blast,上面命令都写清楚了
你已经把命令都写了啊:blastdbcmd -query_bacth idlist -out final
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