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尽可能避免两个引物分子之间3'端有较多碱基互补是什么意思

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解决时间 2021-01-22 18:36
尽可能避免两个引物分子之间3'端有较多碱基互补是什么意思
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设计引物应遵循以下原则:   ①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。   ②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。   ③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC最好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。   ④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。   ⑤引物3'端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。   ⑥引物中有或能加上合适的酶切位点, 被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点, 这对酶切分析或分子克隆很有好处。   ⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。
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如果引物的碱基互补了,那么两种碱基会结合,形成一段小dna链,失效了 引物是引起解旋的dna与之配对,形成两条新的dna链,从而达到dna的复制
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