ORF cDNA 和CDS的区别

ORF cDNA 和CDS的区别

CDS是Coding sequence的缩写,是编码一段蛋白产物的序列,是结构基因组学术语
ORF开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断.当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什么
CDS与开放读码框ORF的区别
（1）开放读码框是从一个起始密码子开始到一个终止密码子结束的一段序列；不是所有读码框都能被表达出蛋白产物,或者能表达出占有优势或者能产生生物学功能的蛋白.
（2） CDS,是编码一段蛋白产物的序列.
（3） cds必定是一个orf.但也可能包括很多orf.
（4）反之,每个orf不一定都是cds.
（5）Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.
Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA
ORF-----translation,CDS----transcription
translation 是理论上的,而transcription则显然是事实存在的.
cDNA为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写
,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链
EST (Expressed Sequence Tag)表达序列标签—是从一个随机选择的cDNA 克隆,进行5’端和3’端单一次测序挑选出来获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp .由于cDNA文库的复杂性和测序的随机性,有时多个EST代表同一基因或基因组,将其归类形成EST簇(EST clusteF)
mRNA携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的RNA.