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转录组测序reads count 很小可信吗

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解决时间 2021-04-02 09:11
转录组测序reads count 很小可信吗
最佳答案
要看情况,总体的测序深度是否够高,如果某个基因或转录本的reads数目仅有1-2条,我们一般认为其确实存在,但是表达量无法准确估计。所以在下结论的时候一般以reads count>1的认为有表达,但是以FPKM>1为可信的表达量,低于该值的表达量可能是不可靠的,有可能很低也有可能高于该值。
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