什么是rep

什么是rep

细菌基因组中广泛分布的短重复序列（repetitive sequence），包括常用的REP（repetitive Extragenic Palindromic,基因外重复回文系列）、ERIC（肠杆菌基因间重复一致序列）和BOX，它们在菌株、种、属水平上分布有差异及进化过程有相对保守性。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类，此方法操作方便，可以大样本进行。REP-PCR分辨效果好，可重复性强，比 RFLP、生化分型，核糖体分型要好。REP-PCR目前可自动化分型，并可建立各种细菌REP、ERIC-PCR分型标准数据库。