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组织与细胞rt-pcr步骤有区别吗

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解决时间 2021-02-20 16:28
组织与细胞rt-pcr步骤有区别吗
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首先同一种物质在肿瘤细胞系和肿瘤组织中的表达有可能存在差别。另外,组织RNA比较容易降解,RT-PCR结果不好,可能跟RNA提取的浓度及纯度有很大关系。建议先将新鲜组织经液氮冻存后再提取,提组织RNA的东西比如研钵,镊子等都要200度干烤2小时去除RNA酶。你的RT-PCR结果不好,有可能是你提取的组织RNA不纯,或者RNA降解了。
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理论上50个cell就可以,但是实际操作中我只看到过牛人从100个cell里面提出来过(用lcm逮的),自己提弄过1000cell的。没有用kit。不同点是用bcp代替氯仿,并且加糖原助沉淀,具体的好处不是很清楚,但是bcp用量小,而且在cell少的情况下,使用糖原可以尽量的降低误操作。 由于细胞的大小,rna量以及你作用时间的差别,不同细胞在抽提rna的量不一致,初作rna提取时一般选择6孔板(或35mm版)做,每孔1.5-2ml,这样你的作用药品不用使用很多,rna提取的量也有保证。以hela 为例,接种量在50万左右,待细胞长到90%时加药品(加入时间一般以你的作用时长为基点,估计到收集时长满),一般提取rna作用时间不会太长,几个小时而已,所以细胞应长得接近饱和时加入药品,之后收集细胞,提取rna步骤就一样了,提取的一孔rna在10-20ug,这些已足够rt使用,具体提取方法站内有许多,搜索就可以了。
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