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麻烦有谁知道,做土壤微生物多样性时,用PCR-DGGE方法与RAPD方法间的区别是什么啊?急救!

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解决时间 2021-05-25 21:25
麻烦有谁知道,做土壤微生物多样性时,用PCR-DGGE方法与RAPD方法间的区别是什么啊?急救!
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PCR-DGGE主要是扩增微生物的核糖体小亚基基因的可变区,如细菌的16S rDNA的V3区,通过变性梯度凝胶电泳可以将不同序列的DNA片段分离开来,不同位置的条带代表不同的微生物,条带切胶回收测序还可以知道是什么微生物.这种方法不仅可以比较不同土壤样品中微生物群落结构的差别,还可以粗略知道微生物群里结构的组成.
RAPD只能比较不同样品中微生物群落是否有区别,其他就不知道了.
做土壤微生物多样性分析时,现在一般不用RAPD方法了,它得到的信息太少,PCR-DGGE用的也越来越少了.克隆文库获得的信息比较全面,结果主流期刊都认可,但是实验工作量非常大.现在454测序技术很有优势,但是价格还有点儿贵.
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