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PCR跑胶的目的是找到目的片段,我们怎么知道哪个是我们要的目的片段呢

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解决时间 2021-02-16 10:37
PCR跑胶的目的是找到目的片段,我们怎么知道哪个是我们要的目的片段呢
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1 预先已知到目的片段的大小,PCR跑胶验证该大小的片段是否跑出来,点Marker就可以区别;

2 预先未知到目的片段的大小,比如5‘RACE PCR,这将出现的片段(一般是最大的条带)克隆,测序,然后看是不是所要的带追问如果我们不知道目的片段有多少个碱基 如果去选择Marker啊 O(∩_∩)O谢谢追答你用一个范围大一点的Marker就行了,比如Fermentas的1Kb ladder,从250bp到10Kb
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还可以检测扩增的特异性。电泳时跟Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段,当然,最终的确定是根据测序结果。
----中国西部生命科学论坛追问但是如果我们不知道目的片段有多少个碱基呢 怎么去比对呢追答引物如何设计出来的?是不是根据别的物种序列,找到别的物种该序列上设计引物的位置,确定中间的碱基数,你的目的片段长度应该和这个差不多。再根据电泳结果中你的片段相对于Marker的位置推测其大小。
电泳时一定让样品和Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段。 常用的DNA Marker有:λ / HindIII DL5000追问但是如果我们不知道目的片段含有多少个碱基呢 怎么去比对呢
设计引物的时候你就应该知道是多大片段了啊,不然你的引物是怎么设计出来的?
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