如何查找一个基因的启动子序列

如何查找一个基因的启动子序列

首先选择Gene的标签，输入基因名，然后点击搜索，然后出来一大堆基因，选择你的那个物种的基因，点击，进去看一下，选择Mapviewer然后找到序列，选择基因的外显子上游2000bp，下载。。。

“search ensembl“标题下search后的下拉框中选中物种名homo sapiens（人），for框中输入基因名pten，点击go  （2）出现的新页面中比较乱，但不要管它，直接寻找“ensembl protein coding gene ”字样的，对，也就是第二个，点击它  （3）新出现的页面也很乱，不过依然不用管它，看到左侧有点肉色（实在不知道怎么描述了）的那些选项了吗，对，就是“your ensembl”下面那一堆，在里面找“genomic sequence”，点它  （4）现在的界面就一目了然了，在“5' flanking sequence”中输入数值确定启动子长度（默认为600），比如1000，点击update；  （5）出现的序列中，标为红色的就是基因的外显子，红色之间黑色的序列就是内含子，而第一个红色自然就是第一外显子了，那么从开始的碱基一直到第一个红色的碱基间自然就是启动子-1000~+1的序列