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求助,autodock对接结果分析

答案:2  悬赏:60  手机版
解决时间 2021-03-03 23:22
求助,autodock对接结果分析
最佳答案
把autodock对接后的结果保存出来,用DS里面的叠合功能把这些小分子和原始配体叠合一下就行了。
用PYMOL可以做的。将autodock的小分子导出PDB格式,大分子部分也导出PDB格式。在maestro中有merge这一项,整合成一个完成的complex形式。在PYMOL中与晶体复合物align,可以得到叠合模式图。
全部回答
如果你装了mgltools, 看对接结果就很方便了 直接在analyze-docking-open 打开你的对接后得到的文件 很至关, 然后analyze-conformations-play 可以看到所有的对接结果 再analyze-clusterings-show 就可以大致知道主要的对接结果
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