为保证甲型H1N1流感疫苗接种安全，防范疫苗接种过程当中可能会出现的一些不良反应，吉安市适时建立了甲流疫苗接种叫停机制。
对吉安市近期接种甲流感疫苗后反应统计显示，接种甲流疫苗后发生不良反应者都很轻微，而且主要发生在接种后的24小时内，因此如果接种疫苗后出现红肿、瘙痒症状不用担心，很快就会消除，如果反应剧烈，应该及时就医治疗。个体差异不同出现一些反应是正常的。据临床实验看，至少有85％以上的人群接种甲型H1N1流感疫苗以后具有保护作用。
目前，吉安市甲流感疫苗接种工作正在顺利进行，并没有受种者出现严重的异常反应，预计全市月底前共有5.7万人接种甲流感疫苗，到年底将有16万余人接种到甲流疫苗。接种过程中一旦出现规定的疑似预防接种异常反应情形，将立即叫停接种工作，以及时有效应对可能出现的严重疑似预防接种异常反应，确保接种安全。