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高斯几何优化分子结构怎么得到键长键角数据

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解决时间 2021-03-20 10:23
高斯几何优化分子结构怎么得到键长键角数据
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最后把每个势能与其对应的数值plot出来就是此分子关于该自由度的势能面。自由能面则需要动力学或蒙特卡洛模拟才能得到、键角等等),势能面基本只用于小分子量化计算区别就是势能和自由能的区别,比如扫描分子中某一几何自由度(键长,其中每个点上把该自由度固定在该数值,比如对某系统跑了若干步动力学(足够长),最后统计出该变量的概率分布函数。具体应用里,取若干个数值点,取个负对数就得到了关于该变量的自由能面,然后在这个限制条件下对分子其它几何自由度进行优化得到一个能量(势能),其中每一步的时候都把感兴趣的变量值记录下来
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