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如何利用Aspera快速上传转录组数据至NCBI的SRA数据库

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解决时间 2021-03-06 17:25
如何利用Aspera快速上传转录组数据至NCBI的SRA数据库
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Unigene其实没有一个标准的定义。大体的概念是经过去冗余之后得到的基因序列,这条序列和其他的序列是非冗余的,也就是理论上其他序列都和此序列代表的不是同一个基因。或者是经过聚类后得到的不同的类,类和类之间是非冗余的,每个类可以认为唯一的代表一个基因。不同的去冗余和聚类的方法得到的结果都可以称为unigene。
另外NCBI上也有Unigene的概念,是NCBI用自己的方法对序列进行聚类,它认为每一个类都唯一的代表一个基因,并赋予一个编号:物种名字.数字,比如小麦的一个例子:Ta.191,这也是较常用的Unigene.
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