自然人独资公司变更法人代表和股东，双方法人都有到场，但是公章没有备案，是否有效？

我有一个自然人独资的一般纳税人公司，开票金额比较大是万元版的，公司有两个公章一个是备案过的，一个是收发快件用未备案的，新法人占30%股份，另外个他的朋友做股东占70%股份(未到场)，去工商变更法人和股东的时候，包括股东会决议，公司章程修正案，公司登记(备案)等等材料，双方法人都有到场签字，但是公章拿了未备案的公章，变更材料上需要盖章的地方都是用了这个章，问下这样是否有法律效力，现在工商这边还在审核资料中，除了重新做资料外，有没有其他补救的办法，如果三证都变更成功后，新法人做什么违法的事情，我这边有没有责任？

工商局的要求是没有法律依据的，只有是股东会的合法决定，依据公司法和公司章程股东会依法变更法人代表，工商局没有权力一定要让原法人代表到场。

应该不是吧。