DNA中含有什么杂质会干扰PCR过程
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解决时间 2021-03-01 06:20
- 提问者网友:未信
- 2021-03-01 02:49
DNA中含有什么杂质会干扰PCR过程
最佳答案
- 五星知识达人网友:酒者煙囻
- 2021-03-01 04:26
DNA中会影响PCR过程的杂质有:
若提取DNA时某些杂质如DNAase、RNAase、RNA等会对PCR产生影响。
另外Taq酶、镁离子、DNTP也会产生影响。
酚、氯仿、SDS、蛋白酶、蛋白等。
标准的PCR过程分为三步:
DNA变性
(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA
退火
(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。
延伸
(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。
每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如图所示:现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度。
检测
PCR反应扩增出了高的拷贝数,下一步检测就成了关键。荧光素(溴化乙锭,EB)染色凝胶电泳是最常用的检测手段。电泳法检测特异性是不太高的,因此引物两聚体等非特异性的杂交体很容易引起误判。但因为其简捷易行,成为了主流检测方法。近年来以荧光探针为代表的检测方法,有逐渐取代电泳法的趋势。
若提取DNA时某些杂质如DNAase、RNAase、RNA等会对PCR产生影响。
另外Taq酶、镁离子、DNTP也会产生影响。
酚、氯仿、SDS、蛋白酶、蛋白等。
标准的PCR过程分为三步:
DNA变性
(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA
退火
(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。
延伸
(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。
每一循环经过变性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍。如图所示:现在有些PCR因为扩增区很短,即使Taq酶活性不是最佳也能在很短的时间内复制完成,因此可以改为两步法,即退火和延伸同时在60℃-65℃间进行,以减少一次升降温过程,提高了反应速度。
检测
PCR反应扩增出了高的拷贝数,下一步检测就成了关键。荧光素(溴化乙锭,EB)染色凝胶电泳是最常用的检测手段。电泳法检测特异性是不太高的,因此引物两聚体等非特异性的杂交体很容易引起误判。但因为其简捷易行,成为了主流检测方法。近年来以荧光探针为代表的检测方法,有逐渐取代电泳法的趋势。
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- 1楼网友:我住北渡口
- 2021-03-01 05:33
I (Li Bai) the Moonlight before the bed, it seems hoary frost on the floor.
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