挂载两块硬盘时，启动速度超慢

我的电脑挂了两块硬盘，启动时进入系统速度很慢，进入桌面后，会在桌面卡很久，才能进行操作。
但是当我把1T的硬盘拔掉后，启动速度很快，进入桌面马上能够操作。
我用diskgenius检测过硬盘，没有坏道。
请问是什么问题导致的呢？怎么解决？
硬盘信息如下：

产品 希捷 ST1000DM003-9YN162
大小 1 TB
转速 7200 转/分
缓存 64 MB
硬盘已使用 共 535 次，累计 2068 小时
固件 CC4B 接口 SATA III
数据传输率 600 MB/秒
特征 S.M.A.R.T, APM, 48-bit LBA, NCQ

产品 希捷 ST3500418AS
大小 500 GB
转速 7200 转/分
缓存 16 MB
硬盘已使用 共 1403 次，累计 5771 小时
固件 CC45

接口 SATA II
数据传输率 300 MB/秒
特征 S.M.A.R.T, 48-bit LBA, NCQ

以前使用正常，大概是在我用分区魔术师为C盘扩容之后，出现这种问题（扩容的盘是500G那块）

主板BIOS设置主次硬盘，

因为你启动系统后，系统会预读所有盘的信息，再加上你1T的硬盘信息量比较多当然会比较卡了，不过你可以试着优化一下，看能否开机的时候不检查这个盘。

你好！ 该分区分区 有些麻烦避免不了 （如倒腾文件 做系统） 软件倒腾系统 分区表什么的 肯定效果好不了 为什么 因为整合的软件太多 硬件自身的系统也不一（如BIOS整合力） 如果对你有帮助，望采纳。