开放阅读框的发现

开放阅读框的发现

经多次应用发现，5.0的结果很理想，它是介于正、误之间的阈值。 使用方法: 首先选择你测试的序列的来源（物种），然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可。但输入序列的长度不得小于50bp。结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置。通常， ORF Finding 会把您提交的序列进行检测，然后根据阅读框的次序（+1,+2, +3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息。如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话，则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出。编码区域的详细信息包括：
·Numb x： 编码区编号。从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目。
·Predicted start、Predicted end: 预测的基因编码区的开始、结束。是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置。
·Reading frame：阅读框。六种框架（每条链三种，对应三种不同的起始密码子）中的哪一种。·Type：类型。说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的。
·ORF start、ORF end：开放式阅读开始、结束。即这一编码区的起始和结束。它除包括编码蛋白质的核酸序列外，还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等。
·Spectral：吸收光谱。 该段核苷酸的吸收光谱数。
·ORF length：ORF长度。·Max likelihood：最大可能性。请参考 测试过程 中的 编码可能性。
·MLE length score：最大可能性估量长度评估。即该编码区上编码部分占整个ORF区的比例。
·Quadratic discriminant：二次判别式的值。对于编码区趋向于取大值，非编码区趋向于取小值。