影响蛋白质二级结构形成的因素有哪些?

影响蛋白质二级结构形成的因素有哪些?

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影响蛋白质二级结构形成的因素:1、与溶剂分子（一般是水）的相互作用；2、溶剂的ph和离子组成；3、蛋白质的氨基酸序列（最主要的因素）。而他们是通过影响稳定二级结构的作用力（氢键、范德华力、疏水作用力和盐键）来影响蛋白质二级结构的形成的。 如：一条肽链的氨基酸序列中存在多聚丙氨酸，在ph7的水溶液中能自发形成α螺旋结构，因为ala的r基小且不带电荷。 一条肽链的氨基酸序列中存在多聚异亮氨酸不能形成α螺旋，因为ile的α-碳原子附近有较大的r基，造成空间位阻。而多聚脯氨酸的α-碳原子参与r基的吡咯的形成，肽键不惧酰胺氢，无法形成氢键和α螺旋。 肽链的氨基酸序列中脯氨酸、甘氨酸经常形成β-转角，因为pro具有环状结构和固定的φ角，有助于β-转角形成，促进多肽链自身回折，也有助于β折叠片的形成。gly无侧链，易于调整空间位阻，易于β-转角的形成。 而ph能影响氨基酸的带电荷性，如多聚赖氨酸在ph7不形成α螺旋，因为在此ph下lys的r基带正电荷，静电排斥，不能形成内氢键，而在ph12时自发形成α螺旋。 溶液的离子和溶剂的介电常数不同，影响盐键，通常盐键因非极性溶剂的加入而加强，加入盐类而减弱。

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二级结构到底由什么决定很难有一个确切的说法，因为决定二级结构的因素很多，以目前的预测水平也无法准确的预测出一段序列到底会形成什么样的二级结构。不过，二级结构的形成还是存在一些主要的影响因素，比如说氢键。α螺旋和β折叠的主链氢键排布上有很大的差别，在疏水聚集上也有影响，有时候通过查看氨基酸序列的特征可以分析出来。另外，一些氨基酸的结构也对二级结构的形成有一定的影响，比如较大的侧链不容易存在于α螺旋中。有时候二级结构的形成还需要三级结构的支持。 总之，蛋白质的结构形成是个很复杂的问题，不是一两个因素就能决定的，当然它们都要尊守能量最低的原则，最终的稳定结构一定是能量(自由能)最低的。 补充：推荐答案中关于蛋白质结构形成的说法并不准确。首先，并不是所有蛋白都是球形蛋白；第二，球形蛋白的折叠机制(结构形成过程)是复杂的，并不是单纯的先形成二级结构再形成三级结构，这只是其中一个假说：框架模型。有的二级结构的形成还需要三级结构的支持。