如何在linux系统下安装netcdf

如何在linux系统下安装netcdf

NetCDF文件是一种科学数据存储格式，广泛用于大气、海洋和地球科学。NetCDF也是一个函数库集合，提供给用户一整套使用和操作该种格式数据的方法。该格式是跨平台的，且可以使用C、Fortran和Matlab等多种语言进行操作。

安装过程如下：

（1）从http://www.unidata.ucar.edu/downloads/netcdf/index.jsp官方网站下载源程序包。最新版为4.0.1，我安装的是3.6.3，测试成功。

（2）假设源程序包保存在/home/fengwei/netcdf-3.6.3文件夹下，打算安装在/usr/local/netcdf路径里。进入root后，操作如下：

　　mkdir /usr/local/netcdf

　　cd /home/fengwei/netcdf-3.6.3

　　./configure --prefix=/usr/local/netcdf

　　make check

　　make

　　make install

（3）安装完成后，/usr/local/netcdf/文件夹下存在4个文件，分别为bin,include,lib和share。

（4）针对感兴趣的某一nc文件，编写相应的fortran代码(如test.f90)，其中应包括include
'netcdf.inc'，并调用NetCDF给定的函数对nc文件进行读取和写入等操作。

（5）编译fortran代码，以intel fortran编译器为例，其他的编译器基本一致;

　　ifort -c -I/usr/local/netcdf/include test.f90

　　ifort -o test test.o -L/usr/local/netcdf/lib -lnetcdf

（6）运行

　　./test

完毕！

由于CLM模型中需要涉及NETCDF的内容，因此需要再linux下对netcdf进行安装。
NETCDF介绍：
NetCDF是由大气研究大学协会（University Corporation for Atmospheric Research，UCAR)的Unidata项目开发的 (参见9.2网络帮助中有关NetCDF部分)。NetCDF由于其灵活性，能够传输海量的面向阵列（array-oriented）数据，已经被采纳用于陆地，海洋和大气科学。NetCDF数据集的一个例子就是北美地区的20个格网集合，每个格网尺寸为30公里，每一个格网都有自己的高程级别。对于每个格网层的每个格网单元，都有关于12个大气指标的超过一年时间的每小时测量记录。因此，它被称为“多维数据（multi-dimensional data）”。参考来源：http://www.esrichina-bj.cn/old/market/uc/2006-3/123.htm
NETCDF安装：
由于一般linux下会含有netcdf的内容，因此对netcdf进行安装时，只需从linux系统下调出netcdf内容，通过命令进行安装。命令如下：
sudo aptitude install libnetcdf-dev libnetcdf4
便可在/usr/locl/include下增加Netcdf的相关内容 :)
(1)Sudo是允许系统管理员让普通用户执行一些或者全部的root命令的一个工具.
(2)aptitude软件包管理器