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给你一万七千多条基因序列,每条为300碱基数,要分别计算出每条的G和C含量。

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解决时间 2021-02-14 10:22
计算后筛选出GC含量在一定范围内的基因序列。 打个比方,有一组数,abcd打乱顺序并重复约300个,找出其中a和c共多少个。
最佳答案
有一款软件可以快速测算出GC含量:DNAStar软件。
DNAStar软件包里有个EditSeq,打开,依次点击File、Open,打开所要分析的序列,选定打开的序列后,依次点击Goodies、DNAStatistics,就会弹出GC含量信息。

不知道是不是你要的答案。
全部回答
你好! 这个比方还不如别打的好。 简单的编程问题。基本思想是: 首先设定一个一万七千多的循环量, 再文件中依次读入每条基因序列(一次一条), 设定个统计量,逐个判定该基因序列里的字符,=G或=C 是,统计量+1; 判定最后统计量是否在目标范围, 是则将该基因写入新的文件中。 重复循环。 随便什么计算机语言都可以做,C, VB 等等 我的回答你还满意吗~~
用excel就可以,把序列复制到excel里 如果序列在一个单元格内,如A1 在B1输入公式 =(SUMPRODUCT((MId(A1,ROW($1:$99),1)="G")*1)+SUMPRODUCT((MId(A1,ROW($1:$99),1)="C")*1))/LEN(A1) 再将B1的单元格格式设置为百分比即可 如果序列在一列内,如A列,每个字母分在A列的不同的单元格内 B1输入公式 =((countif(A:A,"G")+(countif(A:A,"C"))/counta(A:A) 将B1的单元格格式设置为百分比即可
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