给你一万七千多条基因序列,每条为300碱基数,要分别计算出每条的G和C含量。
答案:3 悬赏:0 手机版
解决时间 2021-02-14 10:22
- 提问者网友:精神病院里
- 2021-02-13 19:50
计算后筛选出GC含量在一定范围内的基因序列。 打个比方,有一组数,abcd打乱顺序并重复约300个,找出其中a和c共多少个。
最佳答案
- 五星知识达人网友:妄饮晩冬酒
- 2021-02-13 21:23
有一款软件可以快速测算出GC含量:DNAStar软件。
DNAStar软件包里有个EditSeq,打开,依次点击File、Open,打开所要分析的序列,选定打开的序列后,依次点击Goodies、DNAStatistics,就会弹出GC含量信息。
不知道是不是你要的答案。
DNAStar软件包里有个EditSeq,打开,依次点击File、Open,打开所要分析的序列,选定打开的序列后,依次点击Goodies、DNAStatistics,就会弹出GC含量信息。
不知道是不是你要的答案。
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- 1楼网友:末日狂欢
- 2021-02-13 22:59
你好!
这个比方还不如别打的好。
简单的编程问题。基本思想是:
首先设定一个一万七千多的循环量,
再文件中依次读入每条基因序列(一次一条),
设定个统计量,逐个判定该基因序列里的字符,=G或=C 是,统计量+1;
判定最后统计量是否在目标范围,
是则将该基因写入新的文件中。
重复循环。
随便什么计算机语言都可以做,C, VB 等等
我的回答你还满意吗~~
- 2楼网友:十鸦
- 2021-02-13 22:15
用excel就可以,把序列复制到excel里
如果序列在一个单元格内,如A1
在B1输入公式 =(SUMPRODUCT((MId(A1,ROW($1:$99),1)="G")*1)+SUMPRODUCT((MId(A1,ROW($1:$99),1)="C")*1))/LEN(A1)
再将B1的单元格格式设置为百分比即可
如果序列在一列内,如A列,每个字母分在A列的不同的单元格内
B1输入公式
=((countif(A:A,"G")+(countif(A:A,"C"))/counta(A:A)
将B1的单元格格式设置为百分比即可
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