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我要研究的一个基因有多种转录变体(transcript variant),如何设计引物来分析基因的表达情况?

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解决时间 2021-02-18 00:12
我要研究的一个基因有多种转录变体(transcript variant),如何设计引物来分析基因的表达情况?
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如果是针对总的基因表达产物,可以寻找变体的共有序列(common sequence)——针对共有RNA序列的特异性探针和针对共有多肽序列的特异性抗体,分别用于检测mRNA表达水平和蛋白质水平。
如果是想检测某个剪接变异体,可以针对其特有序列设计探针、制备抗体。
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探针法行吗
看看这个基因在你的细胞中的表达情况。
你好! 如果是针对总的基因表达产物,可以寻找变体的共有序列(common sequence)——针对共有RNA序列的特异性探针和针对共有多肽序列的特异性抗体,分别用于检测mRNA表达水平和蛋白质水平。 如果是想检测某个剪接变异体,可以针对其特有序列设计探针、制备抗体。 希望对你有所帮助,望采纳。
具体的中文怎么表达我不清楚,不过mRNA有transcript variant 表明最终翻译表达的蛋白可能有不同的isoform,这些isoforms有同样的名称,他们的基因名称一样。比如一个m基因,它的mRNA有2个transcript variant :transcript variant 1和transcript variant 2,表达的蛋白是M,有两个isoforms,分别是 M isoform 1和M isoform 2(也许会有通用的不同后缀,如α,β等)。它们也许在功能上作用相似,或不同,要查具体的资料才知道。要看你的具体需求确定需要哪个transcript variant ,或者直接找所有transcript variant 的相同序列(如果是设计引物的话)。不知道这个答案能不能帮到你。
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