结算时，承包人按计入综合单价的材料预算价格的99%退还发包人。不再计取总承包服务费

这话是什么意思？结算时承包人按综合单价=清单单价材料预算价的99%还给发包人，他岂不是1分不挣。不再计取总承包服务费就是说已经计取了，可是99%都还了不是亏了？请知情者指点迷津谢谢

不是啊。
七、发包人供应材料、设备的计价方法
发包人自行供应材料、设备，并运至承包人指定地点的。投标报价时应按材料、设备预算价格计入分部分项的综合单价内；结算时，承包人按计入综合单价的材料预算价格的99%退还发包人。不再计取总承包服务费。

理解有误：前提是发包人供应材料设备哈，发包人供应给承包人，承包人没有发生费用支出，而发包人供应的这些材料设备在投标人综合单价中是已经计算了其费用的，只是价格不同而已，因此，发包人把材料设备供应给承包人后，当然要扣除合同综合单价中的甲供材料设备费用。只扣99%,还留了1％的费用给承包人呐。哪来亏了一说？

前面还有话的，这是断章取义了。

你好！ 也就是说，施工方相当于拿了分包项目材料总价的1%作为建设方给施工总承包方的总承包服务费。 希望对你有所帮助，望采纳。