终止DNA转录的方式

终止DNA转录的方式

原核生物转录的终止
一. 终止子的种类
1.不依赖 ρ因子的终止子(内在终止子) :体外实验中,只有核心酶和终止子就足以 使转录终止。
2.依赖ρ因子的终止子:蛋白质辅助因子--ρ因子存在时,核心酶终止转录。
上述二者有共同的结构特征(序列差异)。
1.不依赖 ρ因子的终止子(强终止子)
结构特征:一是形成一个发夹结构茎，7～20 bp的IR序列形成(富含G/C)环，中间不重复序列形成发夹结构的突变可阻止转录的终止；二是6～8 个连续的U串(发夹结构末端)。
2.依赖 ρ因子的终止子
(1) 结构 IR序列中的 G/C 对含量较少,发夹结构末端没有固定特征；
(2) 靠与ρ的共同作用而实现终止。
二. 原核生物转录的终止
1.不依赖ρ因子的终止子终止转录
(1)新生RNA链发夹结构形成,造成高度延宕(典型的有60秒左右)；
(2)RNApol暂停为终止提供了机会 ,6～8个连续的U串可能为RNApol与模板的解离提供了信号，RNA-DNA之间的 rU-dA 结合力较弱，于是:RNA-DNA解离 → 三元复合体解体 → RNApol解离 → 转录终止；
(3)真正的终止点不固定,在 U串中的任何一处；
(4)IR序列和U串同等重要，IR中的G/C对含量的减少，U串的缩短或缺失；
(5)DNA上与U串对应的为富含A/T的区域说明:AT富含区在转录的终止和起始中均起重要的作用。
2.依赖 ρ因子的终止子终止转录
(1) 通读(read through):ρ 因子的转录终止过程中, RNApol 转录了 IR 序列之后,虽发生一定时间的延宕,但如果没有 ρ 因子存在,则RNApol 会继续转录；
(2)ρ因子
a.活性形式为六聚体，促进转录终止的活性,NTPase 活性；
b.RNA长度大于50nt时,依赖RNA的NTPase活性最大，说明:ρ因子识别和结合的是RNA；
(3)ρ因子对终止子的作用
a.ρ因子与RNA结合(终止子上游的某一处,RNA的5'端 )
b.ρ因子沿RNA从5'→3'移动(NTP水解供能)(终止子处的较长时间的延宕给ρ因子追赶的机会)
c,ρ因子与 RNApol 相互作用而造成转录的终止RNA Pol转录DNA，ρ因子附着到RNA识别位点上，ρ因子跟在R NA Pol 后沿RNA移动，RNAPol在终止位点停下,并被ρ因子追上，在转录泡中ρ因子使DNA-RNA杂种双链解开，转录终止,释放出RNA Pol, ρ子和RNA；
(4)终止反应还需要 RNA 与 DNA 的相互作用，即 : 需要一定的RNA序列，因为:其与模板的结合力必须弱到一定数值,才能配合ρ因子与 RNApol 的作用
(发夹结构下游的AU序列)，序列不同的终止子→不同的终止程度→基因表达调控的途径之一。
希望能够对你有所帮助。

终止DNA转录分两种情况，一种是依赖于ρ的终止：ρ因子与RNA聚合酶结合，是RNA聚合酶的构象发生改变，停止向前移动，转录终止；一种是不依赖于ρ的终止：1、存在反向序列，想成富含G-C的发卡结构。2、编码链上随后是一连串的T，使RNA聚合酶脱离模板

终止子按其作用是否需蛋白因子的协助至少可以分为两类：一类是不依赖ρ因子(蛋白性终止因子)的终止子，这类终止子在序列上有一些共通的特点，即有一段富含GC的反向重复序列，其后跟随一段富含AT的序列，因而转录生成的mRNA的序列中能形成发夹式结构，后继一连串U，正是RNA聚合酶转录生成的这段mRNA的结构阻止RNA聚合酶继续沿DNA移动，并使聚合酶从DNA链上脱落下来，终止转录。另一类是依赖ρ因子的终止子，即其终止转录的作用需要ρ因子的协同，或至少是受ρ因子的影响。

在DNA分子上有终止转录的特殊碱基顺序称为终止子（terminators），它具有使RNA聚合酶停止合成RNA和释放RNA链的作用。这些终止信号有的能被RNA聚合酶自身识别，而有的则需要有ρ因子的帮助。
1.ρ因子是一个四聚体蛋白质，它能与RNA聚合酶结合但不是酶的组分。它的作用是阻RNA聚合酶向前移动，于是转录终止，并释放出已转录完成的RNA链。
2.对于不依赖于ρ因子的终止子序列的分析，发现有两个明显的特征：即在DNA上有一个15～20个核苷酸的二重对称区，位于RNA链结束之前，形成富含G-C的发夹结构。接着有一串大约6个A的碱基序列它们转录的RNA链的末端为一连串的U。寡聚U可能提供信号使RNA聚合酶脱离模板。