有没有大神能够详解一下什么是功能SNP位点和标签SNP位点啊？
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解决时间 2021-02-15 12:20
- 提问者网友：皆是孤独
- 2021-02-14 13:32
有没有大神能够详解一下什么是功能SNP位点和标签SNP位点啊？
最佳答案
- 五星知识达人网友：煞尾
- 2021-02-14 14:46
功能snp一般指对相应基因表达蛋白活性或表达量有明显影响，从而有明确功能影响的snp，比如cyp2c19的*2、*3多态性的snp可以降低相应酶活性造成慢代谢。由于基因组上snp数量巨大，在做基因扫描确定与疾病关系研究时成本巨大，但遗传时距离近的基因往往形成连锁，snp也成片的传递，既距离越近的snp一起传递给下一代的机率越高而形成连锁，一段片段内一个snp往往可以代表区域内所有snp的类型，那这个snp就称tag-snp，既标签snp，运用标签snp可大幅减少研究时所要检测的snp数量，降低研究成本。追问那选点的时候怎么知道是什么SNP 呢？我是通过Pubmed和hapmap来选点的，最后用hapoview
得到的是tag-SNP？是不是功能SNP只是没有去除高LD的SNP里面的一部分？追答这个要自己查看文献
得到的是tag-SNP？是不是功能SNP只是没有去除高LD的SNP里面的一部分？追答这个要自己查看文献
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