测序结果不好的序列能够做系统发育树吗

测序结果不好的序列能够做系统发育树吗

首先要用你的序列blast，比较一下同源性，看看哪些同源性较高，下载同源性高的序列可以用软件自动生成，系统进化树

有很多方法，可以下载软件也可以在线构建。 在线构建可将你的序列输入pubmed的blastn中进行对比，结果中有一种就是系统发育树，但里面残余对比的序列太多，逆序挑选一下。 软件有很多，比较简单的是dnastar中的megalin，但结果比较粗。 推荐用clustal x软件进行同源性比对后，运用mega3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树，也很简单，看看说明就会。 比较公认的严谨的是philip系列软件，但操作复杂。