如何保护移动硬盘的某个分区？

我的移动硬盘分了两个分区，一个是用作备份的，一个是用作移动存储的。为了安全，我想把用作备份的分区给保护起来，希望的达到的效果就是别人没有密码的情况的下不能打开这个分区，当然也就不能存取文件或者访问文件了，像一些加密软件好像就是为了保护里面的文件不被别人看见而已。
请问一下谁知道怎么办？ 怎么让我的备份分区受密码保护？ 还请不吝提供！！！

用Partition Magic 这个软件来分区，一般分成fat32，如果想下载单个文件为4g以上的文件，就把那个盘分为ntfs的。