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ISSR就一条引物吗?

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解决时间 2021-03-20 16:45
ISSR就一条引物吗?
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SSR即为简单序列重复又称微卫星(microsatellite),是由一类由几个核苷酸(一般为2-5bps)为重复单位组成的简单***重复序列,其重复次数在物种间、品种间甚至个体间具有非常大的变异性,但是这段重复的两个边界一般是相对保守的单拷贝序列。根据保守的边界序列设计引物,即可通过PCR技术分析***重复次数的变异性。SSR首先在人类遗传研究中发现。1982年,Hamada等(1982)在人心肌肌动蛋白(Ha-25)的内含子中发现了一个重复25次的(dA-dT)序列;weber等(1989)对人类基因数据库中的SSR进行了系统的研究,发现其重复次数的高度变异性。Gregan(1992)在检索了人类GenBank后提出,在许多植物中也存在SSR。Morgante和Olivieri(1993)指出用PCR扩增的SSR可以用作植物的分子标记,SSR已经用于植物的遗传作图(Bell and Ecker,1994)。由于SSR多态性丰富,一般呈共显性遗传,而且覆盖整个基因组的编码区和非编码区,非常适于遗传图谱的构建,成为一种最有希望代替RFLP的新兴分子标记。但是,由于扩增SSR产生的片段较小(一般为100—300bps),而且其多态性片段差异小,有时仅为一个核心序列重复单位的差异1-6bps),故一般的琼脂糖凝胶电泳难以有效检测。早期的方法是在PCR反应体系中将反应底物dNTP?s中的一种用放射性同位素标记,通过测序胶分离扩增产物,放射自显影检测多态性(Zhao et. al. ,1992)。最近的研究倾向于用高分辨率琼脂糖凝胶检测(Wu et. al. ,1993;Akagi et. al. ,1997),或PAGE结合银染技术检测SSR的多态性(Panaud et. al. ,1996)。
ISSR(inter simple sequence repeat)顾名思义就是简单序列重复间区的DNA序列,该标记技术是由Zietkiewicz et al. (1994)提出的,检测的是基因组中两个SSR之间的一段短的DNA序列上的多态性。利用植物基因组中广泛存在的SSR序列,设计各种能够与SSR序列结合的PCR引物,对两个相距较近、方向相反的SSR序列之间的区段扩增。ISSR所用的PCR引物长度在20bps左右,因此可以采用与常规PCR相同的条件,其稳定性比PAPD好。ISSR标记呈典型的孟德尔式遗传,一般表现为显性或共显性。近年来ISSR标记已经广泛应用于植物遗传与育种的各个研究领域。研究表明,基于双核甘酸重复序列基元(AC)n的序列非常适合于小麦的染色体作图(Kojima et al. ,1998);而基于(AG)n和(CT)n序列的ISSR在柏树和松树中极具应用价值(Tsumura et al. ,1996)。
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是的。
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