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如何发现与lncRNA相互作用的蛋白

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解决时间 2021-11-11 10:29
如何发现与lncRNA相互作用的蛋白
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这个问得太宽泛了,回答压力大啊。首先要看是根据研究对象分类,还是关注的层面分类- 根据研究对象可以大致分为动植物,人类健康和微生物1. 动植物方向近年热点包括基因组辅助分子育种,和杂合物种(如水产、林木等)基因组图谱绘制。当然群体进化一直是生物学永恒的问题,热度从未衰减。2. 人类健康方面主要是各类疾病的研究,首先,基因组学是定位单基因病(孟德尔遗传病)致病位点的利器;其次,基因组学被广泛应用于筛选复杂疾病(如2型糖尿病、免疫类疾病等)的致病基因;最后,癌症一直被认为是基因病,癌症基因组学也在近年成为一个独立的方向,快速发展。3. 微生物这块关注点包括环境微生物,能源微生物和致病微生物等。基因组图谱绘制、宏基因组,以及和其他方向(如合成生物学)的结合交叉等也都是近年热点。- 按照关注层面分类可分为DNA层面,表观修饰层面和RNA层面1. DNA层面逐步开始由单碱基的改变(SNP或point mutation)逐步过渡到结构变异等序列级别的差异。变异检测的灵敏度和准确度在近年都有很大的提升。2. 表观修饰层面对于DNA甲基化和组蛋白修饰的关注也是一直未减退,越来越多的甲基化图谱被绘制,用于观测细胞发育、癌症发展等;ChIP-chip和ChIP-seq也用来检测了大量的组蛋白和DNA的互作情况。3. RNA层面除了基因表达、可变剪切和microRNA之外,长非编码RNA(lncRNA)成为近年的热点。表达和调控一直以来被认为更适合解释我们观察到的表型差异。不断发展的测序技术和越来越多的尖端成果(如单细胞测序)正在推动着基因组学的发展。
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