dna蛋白质污染能不能做rrbs测序

dna蛋白质污染能不能做rrbs测序

1，蛋白质污染对样品的纯度有明显的影响，不适合RRBS测序。
2， 简化甲基化测序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS)是利用限制性内切酶对基因组进行酶切，然后进行Bisulfite测序对基因组甲基化展开分析。该技术显著提高了CpG区域的测序深度，在CpG岛、启动子区域和增强子元件区域可以获得高精度的分辨率。
3，目前RRBS测序对样品测序的要求较高：
样本类型：完整无明显降解的总DNA
样本起始量（单次）：≥ 5 μg /样本。
样本浓度：≥50 ng/μL
样本纯度：O.D. 260/280为1.8~2.0
适用物种：人和小鼠
4，DNA样品里污染蛋白质会明显降低样本纯度，不适合RRBS测序。

dna蛋白质污染不能做rrbs测序 rrbs是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法，通过酶切富集启动子及CpG岛区域，并进行Bisulfite测序，同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率 样品要求一般有 1）样品总量：大于等于3ug DNA（常规样本），大于等于5ug DNA（FFPE或降解DNA样本 2）样品纯度：OD260 OD280为1.8~2.0 3）样品完整性：DNA无明显降解与蛋白污染，需提供凝胶电泳检测胶图 所以dna蛋白质污染不能做rrbs测序