如何在ncbi编辑biosample
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解决时间 2021-11-21 16:23
- 提问者网友:疯孩纸
- 2021-11-21 04:56
如何在ncbi编辑biosample
最佳答案
- 五星知识达人网友:鸽屿
- 2021-11-21 06:07
如何在ncbi编辑biosample
集成信息检索:ENTREZ系统编辑本段回目录检索服务器可以对有目标的检索记录,但它主要的缺陷在于一次只能从一个数据库中检索到记录;想对一批数据库进行检索的用户必须为每一个目标数据库分别发出一次申请。很明显,这些大量的公用数据库之间存在着逻辑联系。例如,MEDLINE中的一篇论文可能描述一个基因的序列,该基因又在GenBank中出现。其核苷酸序列所编码的蛋白质的序列又存放在蛋白质数据库中。这种蛋白质的三维结构可能又是已知的,结构的数据可能出现在结构数据库中。最后,基因可能定位在某条染色体的某个区域,这类信息存放在图谱数据库中。
在这些生物学上的联系的基础上开发了一种方法;可以通过它查询所有与某一特殊的生物学实体有关的所有信息,而不必按次序查询分立的数据库。这就是一个名为Entrez的分子检索系统。它由NCBI开发和维护,Entrez在所有的主要的数据库计算机平台上均可使用,允许对PubMed(MEDINE)的记录,核苷酸和蛋白质的序列数据,三维结构信息,图谱信息进行集成的访问。全部信息只需经过一次查询。Entrez能够通过数据库之间的两种类型联系:相近性和硬连接来提供集成的信息检索。
集成信息检索:ENTREZ系统编辑本段回目录检索服务器可以对有目标的检索记录,但它主要的缺陷在于一次只能从一个数据库中检索到记录;想对一批数据库进行检索的用户必须为每一个目标数据库分别发出一次申请。很明显,这些大量的公用数据库之间存在着逻辑联系。例如,MEDLINE中的一篇论文可能描述一个基因的序列,该基因又在GenBank中出现。其核苷酸序列所编码的蛋白质的序列又存放在蛋白质数据库中。这种蛋白质的三维结构可能又是已知的,结构的数据可能出现在结构数据库中。最后,基因可能定位在某条染色体的某个区域,这类信息存放在图谱数据库中。
在这些生物学上的联系的基础上开发了一种方法;可以通过它查询所有与某一特殊的生物学实体有关的所有信息,而不必按次序查询分立的数据库。这就是一个名为Entrez的分子检索系统。它由NCBI开发和维护,Entrez在所有的主要的数据库计算机平台上均可使用,允许对PubMed(MEDINE)的记录,核苷酸和蛋白质的序列数据,三维结构信息,图谱信息进行集成的访问。全部信息只需经过一次查询。Entrez能够通过数据库之间的两种类型联系:相近性和硬连接来提供集成的信息检索。
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