如何预测一段多肽链的氨基酸序列

如何预测一段多肽链的氨基酸序列

如何预测一段多肽链的氨基酸序列
有两种方法，一是直接测序列法，常用Edman降解法，在弱碱性条件下多肽连N端氨基酸（阿尔发）与PITC反应，标记为苯氨基硫代甲酰蛋白质。肽链中的第一个肽键变弱，在无水酸的存在下发发生降解，第一个氨基酸（AA1）经过分子重排成为PTH-AA1结合层析技术即可确定氨基酸的性质。C端氨基酸残基分析，可用；羧基肽酶，肼解法；二是串联质谱测定多肽链氨基酸测序。

氨基酸（amino acid）：含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。生物功能大分子蛋白质的基本组成单位，是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。是含有碱性氨基和酸性羧基的有机化合物。氨基连在α-碳上的为α-氨基酸。组成蛋白质的氨基酸均为α-氨基酸。

1.酸水解得8 aa 2.fdnb水解n端，得n端为ala 3.胰蛋白酶断lys or arg之c端，得lys,ala,ser gly,phe,lys asp, tyr 确认序列为ala-ser-lys gly,phe,lys asp, tyr 4-1 糜蛋白酶水解tyr,trp,phe之c端，得asp及1个四肽（lys,ser,phe,ala）和一个三肽 确认序列为ala-ser-lys-phe gly-lys-tyr asp 4-2 三肽与fdnb反应释放dnp-gly，符合预期，即gly-lys-tyr 结论，蛋白质序列为ala-ser-lys-phe-gly-lys-tyr-asp 重点： 胰蛋白酶 trypsin 水解lys or arg之c端 糜蛋白酶 chymotrypsin 水解phe,tyr,trp之c端