利用EST和生物信息学及细胞分子生物学技术研究某基因的功能,试设计技术路线
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解决时间 2021-04-12 13:47
- 提问者网友:人傍凄凉立暮秋
- 2021-04-12 05:29
利用EST和生物信息学及细胞分子生物学技术研究某基因的功能,试设计技术路线
最佳答案
- 五星知识达人网友:风格不统一
- 2021-04-12 07:08
首先,EST序列的测序,得到该基因的EST片段
其次,生物信息学,用Go或者KEGG,分析该基因的功能分类,所在代谢途径等;通过NCBI Blastn,BlastX,tBlastn等比对与该基因同源性较高的基因序列和可能功能;通过ExPASY研究蛋白的特点,二级结构,三级结构等。
之后,根据已得到的信息,依据可能的功能设计细胞分子生物学实验,
例如,1利用已知序列,通过RACE方法获得该基因的cDNA全序列,通过巢式PCR或者Tail PCR的方法获得全基因组序列及promotor序列
2构建过表达载体,在生物体内过表达该基因,看是否获得可见表性
3构建反义RNA载体,或者RNAi载体,使该基因的表达沉默,看是否获得可见表性
4通过同源重组的方法,敲除该基因,看是否获得可见表性
5在该基因缺失的突变生物体中,过表达该基因,看表性能够得到互补t突变
6在该基因启动子后接上报告基因,观察该基因的表达位置
7在将该基因与报告基因后,进行亚细胞定位
8采用real-time-PCR的方法,观察该基因的表达模式
9采用基因芯片的方法,观察与该基因有关的基因
10采用酵母双杂交的方法,寻找与该基因相互作用的蛋白。
等等等等
其次,生物信息学,用Go或者KEGG,分析该基因的功能分类,所在代谢途径等;通过NCBI Blastn,BlastX,tBlastn等比对与该基因同源性较高的基因序列和可能功能;通过ExPASY研究蛋白的特点,二级结构,三级结构等。
之后,根据已得到的信息,依据可能的功能设计细胞分子生物学实验,
例如,1利用已知序列,通过RACE方法获得该基因的cDNA全序列,通过巢式PCR或者Tail PCR的方法获得全基因组序列及promotor序列
2构建过表达载体,在生物体内过表达该基因,看是否获得可见表性
3构建反义RNA载体,或者RNAi载体,使该基因的表达沉默,看是否获得可见表性
4通过同源重组的方法,敲除该基因,看是否获得可见表性
5在该基因缺失的突变生物体中,过表达该基因,看表性能够得到互补t突变
6在该基因启动子后接上报告基因,观察该基因的表达位置
7在将该基因与报告基因后,进行亚细胞定位
8采用real-time-PCR的方法,观察该基因的表达模式
9采用基因芯片的方法,观察与该基因有关的基因
10采用酵母双杂交的方法,寻找与该基因相互作用的蛋白。
等等等等
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- 1楼网友:野味小生
- 2021-04-12 07:50
这个分别是百度百科给出的两个的解释
可以参考下啊http://baike.baidu.com/view/584966.htm
http://baike.baidu.com/link?url=vrkdlwheabpgpiyb_fvez14xudt1oiiadbduvausxehfbvzaepznpjqd_4bn3cmb
因为我是学生物的,所以简单点和你说吧,生物信息学就是将生物里的像蛋白质序列,dna编码啊等等主要偏重于蛋白质和核酸的相关东西信息化,数据化,在此基础上应用计算机方法去研究。而计算生物学就是更具体地在得到这些数据或者预测这些数据的过程中去建模啊,设计算法啊,编程啊什么的。通俗点讲,生物信息学更偏生物一点,计算生物学更偏计算机一点,如果你在大学选这两个专业的话,那么在课程设置上,一个偏向生物的可能就会多点,主要点,另一个就侧重计算机领域的更多点。
但是需要注意的是,这两个的确界限越来越模糊,区别越来越小。
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