从两个方面来讲：
内科和外科的区别是：内科常常按系统，分为呼吸，消化，心血管，泌尿，神经，血液科等。
外科一般按区域分：如脑外，胸外，普外（常指腹部手术），骨科，泌尿外科。
内科和外科是相互联系，又有区别的，比如，一个胰腺炎患都，水肿轻型可以内科保守治疗，但如果不坏死型就得到外科手术切除。
所以现在只能从功能上将内外科分开，而实际上内外科是一个整体，并且当初医学生，学习的时候并没有将内外科分开学，而是都要学。
需要特别注明的是，内科是临床的根本，外科是在内科的基础上发展起来的，也就是说，一个好的外科医生，必定是一个优秀的内科医生。
内科和外科都是西医的说法，还是看看英文是如何表述的。英文“Medicine”一词，既有内科的含义，也有医学、药物的含义。到了19世纪初，才出现了“Internal Medicine”一词，专指内科，“Internal Medicinl”是内科学。西方也称内科医生为“Physician”，而“Physic”一词有“药品”的含义。在医学上把“内科”规定为主要依靠药物来治疗疾病的科别。英文的外科是“Surgeon”，外科学是“Surgery”。“Surgery”一词来自拉丁文“Chirurgia”，由希腊文“Cheir”（手）和“Ergon”（工作）组合而成。所以西医的“外科”是指通过手术来治疗疾病的科别，以区别通过药物治疗疾病的内科。
英文的内科（Internal Medicine）和外科（Surgery）含义是清楚的，而且不易带来误解。依我看，是中文的翻译有问题。英文的“内科”中有个“Internal”一词，该词有“内部”、“内脏”之义，中文翻译成“内科”，还算有道理。那英文的“外科”（Surgery）一词，根本没有“外”和“外部”的意思，为什么中文翻译成“外科”呢？从字义上直译应该是“手术科”。当初是不是为了与“内科”相区别，就来了一个“外科”，我不得而知，但这种“内”和“外”的区别，确实容易给使用汉语的人造成误解。其实，“内科”翻译成“药疗科”，“外科”翻译成“手术科”就比较准确，不易误会了。
那么，我的上述译法，是否有道理，是否规范呢？让我们来看看临床医学是如何分科，如何命名的。随着科学和医学的不断发展，医学的分支和分科越来越多，越来越细。医学有三大分支：临床医学、基础医学和预防医学。临床医学是研究人体各系统疾病的发病机制、诊断、治疗和预后的科学。我们以临床医学中的外科为例，根据人体的系统分为泌尿外科、神经外科、血管外科等；根据人体的部位分为头颅外科、心胸外科等；按手术方式分为整复外科、显微外科、移植外科等；按疾病的性质分出肿瘤外科；至于口腔科、五官科等都已独立成为了专科。以上分科和命名十分清晰，一目了然，比起“内科”和“外科”的叫法要科学，要明确。医学上根据治疗的手段不同，也分出了放射科、理疗科等。既然是依据治疗的手段来分科，为什么不可以叫“药疗科”、“手术科”呢？
在医学上还把疾病区分为“内科疾病”、“外科疾病”。实际上，外科疾病也不一定都要做手术，比如某部位感染，通过用药可以控制，就不必要做手术，形成浓重了，需要动手术切开引流。胃、十二指肠溃疡是典型的内科疾病，但如果并发穿孔、大出血，那必须要做手术。原先依靠手术的肾结石，现在大部分可以用体外震波碎石排出。原先不能手术的先天性心脏病，如今可以通过手术来纠正。原先只能依靠内科治疗的肝病，现在可以移植肝脏。由于科学技术和医学的迅速发展，医学的各科更趋于交叉，更具有综合性，很难简单地用内科和外科来区分疾病了。
当然，许多外文的中文译名虽不准确、不科学，一旦广泛使用，很难改动，这种现象不仅仅发生在医学中。 我想，如能在“内科”和“外科”后边加个括弧，标成“内科（药疗科）”、“外科（手术科）”，或者医生能对患者做一些口头的解释，就能让一些不懂医学而又好琢磨字义的人少一些疑问了。
内科主要用药物来治疗;外科主要用手术方法来治疗.侧重点不同,但不是绝对的.外科同样也用药物。开膛破肚就是外科，让你完整无缺就是内科 内外科的区别，内科即是保留主体，意在重建，而外科的作用就是将不能修复的患病的主体去除。这也是疾病治疗的一种方法。至于分科嘛，那说来就多了。外科学、内科学、妇产科学、儿科学、神经病学、精神病学、眼科学等等属于二级学科 二级学科再细分如：泌尿外科学、心外科学、心内科学、呼吸内科学这些属于三级学科
（还有很多，说不完了。看一下网址就清楚了。呵呵）
外科手术，内科用药。不过目前随着介入治疗及腔镜治疗的发展，内科外科的界限已经不那么明确了。（还有很多，说不完了。看一下网址就清楚了。呵呵）
http://ask.39.net/question/3498795.html
http://iask.sina.com.cn/b/6345293.html
http://wenwen.sogou.com/z/q728466757.htm
外科以手术为主的一种以小创伤治疗，以对人体最小的损害达到最大的治疗效果。
内科以保守治疗为主，通过各种药物使机体达到健康稳定的状态！