在名牌大学做旁听生将会遇到什么困难？

呃。。你说的也太简略了吧，再详细点。

在清华北大这两所学校，你在自习室里看到的人都不是清华北大的学生，而是准备考研的。每年有成千上万的非清华北大不上的人成为考研学生里的职业玩家。而北大的学生是不允许考研的，除非你保研了，不然本科毕业直接工作。如果你想旁听，在每个大学应该都是允许的。

困难可能就是有的内部资料不好弄，不过你既然去旁听了，不如认识几个那个专业的人，交流交流就好了。