fastQ格式的Illumina中应用

fastQ格式的Illumina中应用

Illmina有多种测序仪，从早起的GA、Hiseq2000、Hiseq2500以及即将推广的Hiseq X,Hiseq2000一个flowcell中包含8个lane，每个lane可以测一个文库或多样本的混合文库，多样本混合文库如果需要后期区分则每个文库需要一个独特的标签，即Index。其中一个lane包含3列(3个Swath)，每一列又包含8个tile，每一个tile又会种下不同的cluster，如图1所示为Hiseq2500的FlowCell的一个表面。