如何根据一段序列知道这段序列属于哪个SNP的上游么,我已经知道它是某一个SNP的上游

这个序列是GAGTCGAGGTCATATCGTCATCCGCTGCTGCTGCTGTG

SNP是两条序列相互比较，有单碱基位点发生变化的位置，才能称作SNP，单一的一条序列在没有对照序列时是没有SNP概念的。
你们导师可能是让你用自己手里的序列与网上数据库里的序列比较看看有没有单碱基突变。你只要在网上数据库找到与你手中相同的基因的序列再与之进行比对，每一个单碱基差异就是一个SNP了。

博凌科为-为你解答：以编码5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor的htr1a基因为例，先进入entrez，选择gene选项，在ncbi中搜htr1a基因，到如下图界面，点基因缩略图，然后点 graphics。点击后的界面如下。这里已经很清楚地标明了snp所 在的位置以及对应的核酸与蛋白序列。但有一点要说明，我注意到这个基因编码的蛋白序列与swissprot的序列有一些差别，很可能是收录的版本不同，或 是有些序列是ncbi直接根据orf形成的。