关于农村宅基地问题，是否有些存在法律盲区

我的母亲原来是农民，父亲原来是集体户口，在北京郊区有一套祖宅，至少几十年了，当地从来没办过宅基地使用权证；父亲退休后就把户口调回了这个祖宅所在地的村子，还是非农业户口，不久前母亲也办了农转非，投靠父亲；户口簿的地址都没有变，只不过户口性质变了（他们没有别的房产）几天前我看国土资源部下发通知说要办理宅基地使用权登记，我咨询了相关部门，都说是我父母已经不是农业户口了，没有资格再享有宅基地了。我很困惑----不发给他们证怎么办？原来宅基地上的房屋怎么算？真按法律来说，他们应该退出这块宅基地，那他们去哪里？他们无处可去呀！有些部门说先这么住着，但哪一天拆迁又怎么办呢？宅基地是祖上传下来的，房屋是他们二十年前辛苦建起来的，现在因为户口性质变化却是不合法的了，他们该怎样保护权利呢？

应该不只你父母一宅基地吧？人多就好办事，人少嘛就完蛋了

应该不是吧。