如何应用primer primer 6.0设计引物

答案:2 悬赏:80 手机版

解决时间 2021-02-08 17:57

提问者网友：了了无期
2021-02-08 08:16

最佳答案

五星知识达人网友：执傲
2021-02-08 08:38

引物设计有3 条基本原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构，再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。引物设计应注意如下要点： 1 引物的长度一般为15-30 bp，常用的是18-2

全部回答

1楼网友：青尢
2021-02-08 10:03

第一步：新建序列（或者通过open直接打开序列）第二步：确定你要设计引物的起始位点,双击下面的序列可以选中一段（暂时先不要管引物长度）第三步：选择作为上游引物select->forward primer,然后你会发现下面的序列上有相关引物第四步：编辑引物,edit->forward primer,可以在文本框中对引物进行添加或删除（在此步骤中加入酶切位点或/和保护碱基）,最下面是发夹结构情况,没有发夹结构最好,参与配对形成发夹结构的碱基对越少越好（此窗口还有tm等信息）第五步：分析引物analyze->duplex formation->forward primer是上游引物形成二聚体情况,不形成最好,参与配对形成二聚体的碱基对越少越好；analyze->****->forward primer（analyze菜单中有很多可以对引物进行评估的功能,根据菜单名字便可知道）第六步：设计下游引物（同上游引物设计）第七步：将设计好的引物进行检查是否移码等等,然后从中ctrl+c复制出来,然后发给公司合成.

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