公安机关撤销案件后留案底吗？

两人因琐事发生争吵并互相殴打，对方被我用拳打造成鼻梁骨粉碎性骨折构成轻伤，我被对方用菜刀砍到后腰5cm长口子属轻微伤，公安机关对我立案侦查并传唤我，第二天与对方和解，赔了对方8000元，对方也写了谅解书不再追究我的刑事等责任，公安机关也撤销了案件。请问：这种情况会留下案底吗？案件都撤销快一个月了，却又打电话来叫我去补拍照片（以前未拍），会不会是要建我的档案留案底呢？

未处罚就没关系，刑事案件是要留档备查的，至少保存三十年。这是内部备查的，和你没关系。
你只要没有被处罚，这在查档的时候能看出来的，不会记录进你的档案。

不会的，公安机关是要存档和入档的。