如何批量快速提交序列到 Genbank

如何批量快速提交序列到 Genbank

提交序列常见有两种方式，一种是Bankit ，另一种是Sequin，前者适合少量序列，后者则适合批量的序列。很多新人对 Sequin 望而却步，其实只要做好序列提交的三个文件准备工作，提交序列只需要短短几分钟即可完成，非常快捷，故而强烈推荐使用Sequin这款软件。

许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号，并且要求你在文章发表时，序列可以被读者索取。 ncbi的genbank提供了两个投递方式： 1、在线投递－bankit，特点是比较方便。 2、本地投递文件生成程序——sequin。目前ncbi seqin有mac, pc和unix不同版本。其输出文件需要你通过电子邮件发给ncbi. 另外，上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况。如果大规模的测序如est、 sts和gss序列分别有专门的投递途径。 另外，提醒你的两个问题： 1、对你所投序列所属物种分类（拉丁名）要有所了解，这通常是出错的地方（seqin） 2、在你投递序列到发表文章之间，要注意ncbi发给你的电子邮件，它会询问你在什么时间将序列公布。 具体细节你可以浏览参考资料所指连接。