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16S rRNA序列blast问题

答案:2  悬赏:30  手机版
解决时间 2021-03-27 23:04
16S rRNA序列blast问题 小弟测出了40条序列,分成了14个OTU,每个OTU通过mothur找出了代表序列,用代表序列去NCBI上blast时候,发现分别的两个OTU的代表序列,blast结果是一样的菌种,不知道是什么原因啊,难道不是选择得分最高的菌种么,还是有选择性的选择啊,小弟是刚接触克隆文库,很不懂啊,还有什么时候,公司给出的序列在制作进化树时候,需要反向互补,什么意思啊,怎么弄啊,求高手指导。。。谢谢
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我做毕业论文,利用PCR做菌种鉴定,现需要其保守序列,是否需要具体到属??? 收费制作的 最好是越精确越好 像品种鉴定 就是一点细微的差别也
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不明白啊 = =!
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